La historia departamental se remonta al año 1992, período en que surge el Departamento de Ciencias Básicas dirigido en esa época por el Dr. Alberto Carvacho Bravo -uno de los fundadores y primer director- y que estuvo conformado inicialmente por académicos provenientes de los Departamentos de Química y Alimentos, de Educación y Ciencias, y de Acuicultura y Recursos Acuáticos del ex Instituto Profesional de Osorno. Luego de la creación de la Universidad de Los Lagos en septiembre de 1993, se decreta su dependencia a la Vicerrectoría Académica de la época.
Luego de dos décadas de existencia como Departamento de Ciencias Básicas, y tras múltiples esfuerzos, nuestra unidad académica adopta el nombre de Departamento de Ciencias Biológicas & Biodiversidad (Depto. CBB) en octubre de 2012, bajo la dirección del Dr. Nelson Colihueque, reconocimiento que los cuerpos colegiados apoyaron en favor de la contextualización de su quehacer disciplinar en la institución.
A lo largo de su historia el Departamento de Ciencias Biológicas & Biodiversidad ha sido dirigido por:
| 1992 | Dr. Alberto Carvacho Bravo |
| 1993 a 1997 | Dr. Gonzalo Mauricio Gajardo Gálvez |
| 1997 a 2001 | MSc. Guillermo Antonio Riffart Richards |
| 2001 a 2003 | MSc. Jaime Arcadio Zapata Madrid |
| 2003 a 2005 | Msc. Erich Henry Rudolph Latorre |
| 2005 a 2009 | MSc. Jaime Arcadio Zapata Madrid |
| 2009 a 2011 | Dr. Alberto German Gantz Pinninghoff |
| 2011 a 2015 | Dr. Nelson Colihueque Vargas |
| 2015 a 2017 | Dr. Carlos Eduardo Valdivia Prats |
| 2017 a 2019 | Dr. Carlos Patricio Aranda Borghero |
| 2019 a 2023 | MSc. Julio Enrique Crespo Soto |
